首先说您第一个问题:牵扯阴茎,就会导致右侧睾丸有点痛。一般来说这种情况可见于附睾炎,睾丸炎,前列腺炎这类的炎症性的疾病,但从您的描述上来看,极其轻微,并且已经3个月了,没有加重,所以您其实做彩超的时候应该做一下阴囊的彩超,看看睾丸附睾有没有问题,如果没有问题,那就不需要特殊处理,药物也不用吃,多改善生活习惯,不要久坐,不要着急,不要憋尿,慢慢的就会好的。
然后,您超声结果为右肾窦区下份见大小约0.4×0.4cm强回声。这个是肾结石,一般来说小于0.8的结石多会自行排出,不会引起腰部的疼痛不适,您的结石比较小,达不到手术的程度,多喝水多排尿,没准儿哪次排尿就自己尿出去了。所以您的右腰痛考虑和结石无关,您可以再去咨询下骨科,看看腰痛是否和肌肉筋膜之类的引发。
综上,您目前不需要手术,如果方便,可以去做一下阴囊彩超进一步确认一下,但很大概率是没有问题。然后咨询一下骨科,排查一下腰痛原因(不是肾结石导致),平时,多喝水是对的,每天饮水量可以在1500到2000毫升或以上。坐飞机的时候即便结石出现问题,也不会有生命危险,也不会导致病情延误加重,最多最多就是疼痛加剧,不用担心,如果真的怕结石出现问题,可以提前备一个药,叫吲哚美辛栓,肛门外用的,飞机上隔一会就起来活动一下,如果疼痛剧烈难忍,可以塞肛门里一粒,半小时就会缓解症状。