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你好！感谢你的信任，看了你的材料，应该问题不大，考虑肠道功能紊乱。
腰部疼痛与肾小结石关系不大。
先说右上腹痛的情况，这个部位的疼痛最常见为肝胆系统问题，但你超声检查没有问题，再就是胃及十二指肠，胃肠镜也做过，只是浅表性胃炎，也不是结肠炎。
那么就考虑肠道功能紊乱，肠激惹，会受不当饮食及情绪影响，会有稀便，但化验大便正常。

腰部疼痛与结石关系不大，因为结石引起疼痛必须是有尿路梗阻，积水，小的结石没有肾盂梗阻是没有症状的，考虑可能为腰肌劳损情况。

你的这个位置考虑肠道，十二指肠是胃的延续，在胃左下方，然后是小肠，结肠，直肠到肛门。整个腹部都有肠道占据。
你描述的腹痛会有腹泻，应该是结肠，不是十二指肠。

治疗方面没有特殊，建议先观察看看，如果再有稀便，最好做个大便常规检查，如果是肠炎应该有炎症细胞，有的时候肠镜检查可能也有误差，轻微的肠炎看不出来。
饮食方面禁食辛辣，啤酒也尽量少喝。
药物方面以调整肠道功能紊乱为主。后续会提供，建议如果一段时间无好转，还是要到消化科进一步检查。
祝你早日康复。

纠正：胃横在上腹部偏左，十二指肠是胃的延续，偏右下，然后小肠、结肠、直肠到肛门。