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你好，你父亲现在右肾萎缩，其实是左肾是功能性孤立肾。左肾现在有结石、积水，如果不处理，就会左肾功能也慢慢丢失，最后不可避免的走向肾功能衰竭。左肾结石手术方法两种，一种是经皮肾镜，也就是在腰背部穿刺到肾盂，建立通道碎石取石，相对来说效率高，出血风险大。另一种是输尿管软镜，就是从尿道、膀胱、输尿管逆行到肾盂取石，效率低，出血风险小。对于你父亲来说，经皮肾镜主要的风险是出血、感染，输尿管软镜主要的风险是感染、多次手术。无论何种方法对你父亲来说风险都比一般人大很多。我个人倾向于经皮肾镜，相对来说，感染的风险小一点。术前需要血液科先看过，明确三系降低的原因。术前有可能需要输注血小板。术前还需要使用抗菌药物，因为尿中有很多白细胞，可能存在感染。如果都能准备好，手术还是可以做的。当然，对于你父亲这种复杂病例来说，不同医生意见不一样是很正常的，具体方案你需要和主管医生充分沟通。