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您好，根据您提供的病历信息来看，胃镜时胃炎伴糜烂，有幽门杆菌感染，应该进行正规的杀菌治疗，连续用药14天，停药一个月后再复查幽门螺杆菌，确定有无根除。肠镜检查提示结肠息肉，病理为增生性息肉，是良性病变。可以在肠镜下进行微创切除。若不切除就要定期的复查。
哪个级别医院能做，那要看这个医院的消化内镜技术水平，一般情况下是可以的。
看看您还有什么问题？

无痛胃镜，无痛肠镜检查与普通的胃肠镜检查的区别是麻醉后在操作过程中病人没有不适的感觉，很舒适的完成检查治疗。由于病人反应轻，能够很好的配合医生操作也非常的顺利。其他就看医生的操作手法和临床经验了。所以要想检查时不难受，就可以选择有经验的医生和无痛胃肠镜检查。技术好的医生不用麻醉，做肠镜也不疼。
您的第二个问题，的确有传染的风险，但不一定真的能传染上。不要担心，目前对宝宝的健康不会有什么的影响，以后注意饮食卫生就行了。若有细菌感染，长大了，才需要正规治疗。

经过正规的杀菌治疗，如果复查还有幽门螺旋杆菌，应该做一下胃镜检查之后再看，需不需要治疗？
若需要治疗，应该选择二线方案，也就是换药治疗。