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不好意思，节假日医院门诊病人巨多，所以没有及时回复你，希望家长理解。
根据你的描述，孩子首先考虑反复呼吸道感染，多为先天性因素或机体免疫功能低下或微量元素和维生素缺乏，或喂养方式不当，以及遗传、护理、居住环境等多种因素综合作用的结果，开学后出现的考虑交叉感染可能性大。建议检查微量元素，合理安排作息，适当锻炼，增强抵抗力，若还是不见好，可以吃点提高免疫力的药物，常见的有转移因子,胸腺肽,匹多莫德,泛福舒,脾氨肽口服冻干粉（复可托）,免疫球蛋白等。这次治疗先暂时不用抗生素，先口服止咳糖浆，两三天之后看看效果，如果不行的话，再加上阿奇霉素。或者去医院检测一个肺炎支原体。另外，你的宝宝反复咳嗽伴有流涕，需要警惕上气道咳嗽综合症。它一般表现为咳嗽大于四周，有白色泡沫痰或黄绿色浓痰，咳嗽以晨起、睡前或体位变化时明显，常有鼻塞、流涕、咽干、异物感、反复清咽等，查体主要发现后壁滤泡明显增生，或见黏液样或脓性分泌物附着。建议五官科就诊，明确是否存在鼻炎鼻窦炎或腺样体肥大等情况，然后针对具体情况予以治疗。

身材矮小是去内分泌科看了吗？做过哪些检查？骨龄片拍过吗？如果都做个检查也是正常的，那在正常标准值的下限也算一个正常范围，可以再关注一段时间，注意营养均衡，合理运动。

也不是说阿奇霉素只能适用在肺炎上面，普通的一个呼吸道的感染都是可以用的，但是如果没有明确的感染的依据，不建议用抗生素，暂时先不用抗生素，根据病情的变化再决定。
至于生长方面，如果所有的检查结果都是合格的，那就先补充铁锌。

可以先用氨溴索口服液的，如果说用了两三天后没有效果，再加上阿奇霉素吧。